Ziraat Fakültesi logosunun tasarımı Türk Bayrağı üzerinde Çanakkale'nin en önemli simgelerinden birisi olan Şehitler Abidesi'nin yerleştirilmesi ve bu iki önemli figürü iki adet sarı başak tanesi çevreleyecek şekilde tasarlanmıştır. Logonun en dış lacivert halkasında ise Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesinin kısaltılmış adı olan ÇOMÜ ve Ziraat Fakültesi yazısı ile Fakültenin kuruluş tarihi yer almaktadır. 2000 yılından itibaren kurumsal olarak kullanılan Ziraat Fakültesi Logosunun tasarımı ise Dr. Öğretim Üyesi Fatih Cem Kuzucu ve Öğretim Görevlisi Mürsel Güven tarafından yapılmıştır.